Bước 1: Nộp hồ sơ Tổ chức, cá nhân nộp đơn đề nghị cấp lại giấy phép đến Trung tâm Phục vụ hành chính công tỉnh Bến Tre, địa chỉ: Số 126A, đường Nguyễn Thị Định, Tổ10, Khu phố 2, phường Phú Tân, thành phố Bến Tre, tỉnh Bến Tre, trong giờ làm việc, sáng từ 07 giờ đến 11 giờ, chiều từ 13 giờ đến 17 giờ từ thứ Hai đến thứ Sáu hàng tuần (trừ ngày lễ, Tết); hoặc nộp trực tuyến. Trung tâm Phục vụ hành chính công tỉnh Bến Tre chuyển hồ sơ đến Chi cục Thủy lợi trực thuộc Sở Nông nghiệp và Phát triển nông thôn.

Bước 2: Xem xét hồ sơ và trình phê duyệt: Trong thời hạn 03 ngày làm việc, kể từ ngày nhận được hồ sơ Chi cục Thủy lợi tham mưu Sở Nông nghiệp và Phát triển nông thôn tổ chức thẩm định hồ sơ và trình Ủy ban nhân dân tỉnh xem xét, phê duyệt, nếu đủ điều kiện thì cấp lại giấy phép; trường hợp không đủ điều kiện để cấp giấy phép thì trả lại hồ sơ và thông báo bằng văn bản nêu rõ lý do không cấp lại giấy phép