Bước 1. Nộp hồ sơ TTHC Chủ đầu tư xây dựng công trình, tổ chức, cá nhân tổ chức hoạt động nộp hồ sơ đến cơ quan có thẩm quyền sau: - Sở Giao thông vận tải (Trung tâm Phục vụ hành chính công số 126A, Đường Nguyễn Thị Định, Khu phố 2, phường Phú Tân, thành phố Bến Tre): thỏa thuận đối với công trình, các hoạt động quốc phòng, an ninh có liên quan đến giao thông đường thủy nội địa trên đường thủy nội địa địa phương, đường thủy nội địa chuyên dùng nối với đường thủy nội địa địa phương (thẩm quyền giải quyết của Ủy ban nhân dân tỉnh); thỏa thuận về nội dung liên quan đến đường thủy nội địa đối với các công trình, hoạt động trên đường thủy nội địa địa phương, đường thủy nội địa chuyên dùng nối với đường thủy nội địa địa phương, hành lang bảo vệ luồng, trừ trường hợp thuộc thẩm quyền giải quyết của Ủy ban nhân dân tỉnh (thẩm quyền giải quyết của Sở Giao thông vận tải). - Cảng vụ (Cảng vụ Đường thủy nội địa Bến Tre số 99/10B, ấp Mỹ An B, xã Mỹ Thạnh An, tỉnh Bến Tre): thỏa thuận đối với hoạt động nạo vét cải tạo vùng nước cảng, bến thủy nội địa, khu neo đậu thuộc phạm vi quản lý.

Bước 2. Nhận hồ sơ TTHC - Trường hợp nộp trực tiếp công chức một cửa, cán bộ tiếp nhận kiểm tra hồ sơ: Nếu hồ sơ không đầy đủ theo quy định thì trả lại ngay và hướng dẫn tổ chức, cá nhân hoàn thiện lại hồ sơ. Nếu hồ sơ đầy đủ thì cấp giấy biên nhận hồ sơ và hẹn trả kết quả theo thời hạn quy định. Nếu tổ chức, cá nhân có yêu cầu cơ quan giải quyết TTHC trả kết quả qua hệ thống bưu chính công ích thì đăng ký tại bước này (tổ chức, cá nhân thanh toán cước phí bưu điện theo quy định). - Trường hợp nộp gián tiếp (qua hệ thống bưu chính hoặc bằng các hình thức phù hợp khác), cơ quan có thẩm quyền tiếp nhận hồ sơ. Trường hợp hồ sơ chưa đầy đủ theo quy định, chậm nhất sau 02 ngày làm việc kể từ ngày nhận hồ sơ phải có văn bản hướng dẫn cho tổ chức, cá nhân hoàn thiện.

Bước 3. Giải quyết hồ sơ TTHC - Trước khi thẩm định Sở Giao thông vận tải, Cảng vụ Đường thủy nội địa Bến Tre lấy ý kiến đơn vị quản lý. - Đối vơi văn bản thỏa thuận thuộc thẩm quyền giải quyết của Ủy ban nhân dân tỉnh: + Trong thời hạn 04 ngày làm việc kể từ ngày nhận đủ hồ sơ, Sở Giao thông vận tải thẩm đinh nếu đủ điều kiện thì báo cáo Ủy ban nhân dân tỉnh (Trường hợp hồ sơ cần sửa đổi, bổ sung Sở Giao thông vận tải thông báo trực tiếp hoặc bằng văn bản những nội dung cần bổ sung hoặc sửa đổi). + Trong thời hạn 01 ngày làm việc, kể từ ngày nhận được hồ sơ và báo cáo của Sở Giao thông vận tải, Ủy ban nhân dân tỉnh ban hành văn bản thỏa thuận gửi chủ đầu tư. - Đối vơi văn bản thỏa thuận thuộc thẩm quyền giải quyết của Sở Giao thông vận tải: + Trong thời hạn 05 ngày làm việc, kể từ ngày nhận đủ hồ sơ theo quy định, cơ quan có thẩm quyền có văn bản thỏa thuận gửi chủ đầu tư (Trường hợp hồ sơ cần sửa đổi, bổ sung Sở Giao thông vận tải thông báo trực tiếp hoặc bằng văn bản những nội dung cần bổ sung hoặc sửa đổi). - Trường hợp không chấp thuận thì phải có văn bản trả lời và nêu rõ lý do.

Bước 4. Trả kết quả Đến hẹn, tổ chức hoặc cá nhân mang phiếu hẹn đến nơi nộp hồ sơ theo thẩm quyền giải quyết nhận kết quả hoặc trả kết quả qua đường bưu điện (nếu tổ chức, cá nhân có yêu cầu).